где...можно выписать справку-счет
С 1 июля текущего года такое понятие, как "справка-счёт", не существует в принципе...
По рукописному договору продавцу нужно присутствовать при постановке на учет
Это не верно, так как законадельством не оговорено каких-либо условий или особенностей (печати, бланки и т.п.) при составлении договра купли-продажи.
Присутствие продавца в регистрационном подразделении МРЭО-МОТОТРЭР необходимо только в том случае, если договор купли-продажи составлен в отношении автомототранспортного средства ещё не снятого с регистрационного учёта (собственно "продавец" требуется для снятия бывшей собственности с учёта).
Если должностное лицо отказываются совершить какое-либо регистрационное действие, то таковой (в мотивированной форме со ссылкой на конкретный пункт конкретного нормативного акта) в письменном виде выдаётся лицу, обратившемуся для совершения юридически значимого действия.